辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化

康峰峰; 秦英英; 韩海荣

doi:10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

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辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化

康峰峰 , 秦英英 , 韩海荣

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康峰峰, 秦英英, 韩海荣. 辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化[J]. 四川林业科技, 2013, 34(4): 1-4. doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

引用本文:

康峰峰, 秦英英, 韩海荣. 辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化[J]. 四川林业科技, 2013, 34(4): 1-4. doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

KANG Feng-feng, QIN Ying-ying, HAN Hai-rong. The Optimization of the SSR Reaction Program and the Reaction System in Researches on Quercus liaotungensis[J]. Journal of Sichuan Forestry Science and Technology, 2013, 34(4): 1-4. doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

Citation:

KANG Feng-feng, QIN Ying-ying, HAN Hai-rong. The Optimization of the SSR Reaction Program and the Reaction System in Researches on Quercus liaotungensis[J]. Journal of Sichuan Forestry Science and Technology, 2013, 34(4): 1-4. doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化

doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

详细信息

北京林业大学省部共建森林培育与保护重点实验室，北京 100083

作者简介:
康峰峰,男,研究方向:森林生态系统结构与功能。

基金项目:
国家林业局行业专项(200804006/rhh-02)"948"国家林业局引进项目(2010-4-15)。
中图分类号: S722

The Optimization of the SSR Reaction Program and the Reaction System in Researches on Quercus liaotungensis

More Information

Key Laboratory for Silviculture and Forest Conservation of Ministry of Education, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China

摘要: 本文针对辽东栎遗传多样性研究过程中的SSR反应程序和反应体系进行了优化研究。优化后的反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性45s,58℃退火45 s,72℃延伸7 min,72℃延伸45 s,33个循环;经优化后的反应体系为30 ngDNA模板,2 μL10×Buffer (Mg²⁺Plus),150 μmol·L^-1 dNTP Mixture,0.3μmol·L^-1上下游引物,1U (5u·μL^-1) Taq酶,反应总体积为20 μL。研究结果对SSR分子标记在栎属植物遗传多样性中的应用也有一定的参考价值。
- 辽东栎;
- SSR;
- 反应程序;
- 反应体系;
- 优化
Abstract: In this paper,optimization researches were conducted on the SSR reaction program and the reaction system for the research process of Q. liaotungensis genetic diversity. The optimized reaction program was to adopt 33 cycles,which included 3 minutes of pre-denaturing at 94℃,45 seconds of denaturing at 94℃,45 seconds of annealing at 58℃,45 seconds of extension at 72℃,and a final extension step was carried out at 72℃ for 7 minutes. The optimized reaction system was as follows:30 ng DNA,2 μL10×Buffer(Mg²⁺ Plus),150 μmol·L^-1 dNTP Mixture,0.3 μmol·L^-1of each primer,1U(5 u·μL^-1) Taq polymerase,and the total reaction volume was 20 μL. The results had a certain reference value for the application of the SSR marker in the research on the genetic diversity of oak plants.
- Quercus liaotungensis;
- SSR;
- Reaction program;
- The reaction system;
- Optimization

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辽东栎SSR反应程序和反应体系的优化

doi: 10.16779/j.cnki.1003-5508.2013.04.001

北京林业大学省部共建森林培育与保护重点实验室，北京 100083

作者简介:
康峰峰,男,研究方向:森林生态系统结构与功能。

收稿日期: 2013-04-24

基金项目:

国家林业局行业专项(200804006/rhh-02)"948"国家林业局引进项目(2010-4-15)。

中图分类号: S722

关键词:

摘要: 本文针对辽东栎遗传多样性研究过程中的SSR反应程序和反应体系进行了优化研究。优化后的反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性45s,58℃退火45 s,72℃延伸7 min,72℃延伸45 s,33个循环;经优化后的反应体系为30 ngDNA模板,2 μL10×Buffer (Mg²⁺Plus),150 μmol·L^-1 dNTP Mixture,0.3μmol·L^-1上下游引物,1U (5u·μL^-1) Taq酶,反应总体积为20 μL。研究结果对SSR分子标记在栎属植物遗传多样性中的应用也有一定的参考价值。